窦性心律不齐若不伴有其他生理不适，一般不需要治疗，长期维持也不会导致异常后果；但若窦性心律不齐伴有各类基础疾病，不针对疾病进行治疗则可能威胁生命。
窦房结是人体心脏的正常起搏点，可以规律地产生冲动并向心脏传导，刺激心脏从而完成心脏搏动。窦性心律不齐是心脏跳动仍以窦房结为起搏点，但出现跳动过快、过慢或不规则跳动的现象。可能是生理性变化也可能是病理性变化。
1、生理性窦性心律不齐：大多数窦性心律不齐都是生理性原因导致，如剧烈运动、焦虑、紧张或喝咖啡、浓茶等，或长期服用阿托品等影响心脏节律的药物。若患者长期存在上述诱因，就会出现长期的窦性心律不齐，此类患者若只是单纯出现窦性心律不齐，而心率快慢在正常范围之内，通常不会造成不良影响；
2、病理性窦性心律不齐：若患者存在基础性疾病，如冠心病、心力衰竭、甲状腺功能亢进症、糖尿病、心包炎等，也会出现长期窦性心律不齐的情况。此时的窦性心律不齐会影响机体健康，可能会导致患者出现头晕、心慌、心悸、胸闷、精神疲劳、乏力等症状，严重时可导致患者出现呼吸困难、黑蒙、 晕厥、心绞痛等症状，甚至会危及生命。
患者存在长期窦性心律不齐时，可以及时进行进一步检查，明确是否存在冠心病、心力衰竭、甲状腺功能亢进等影响心律的疾病。若存在疾病应积极治疗，如果可以排除疾病，日常生活中也要注意规避影响心律的原因，如保持情绪平稳、减少剧烈运动或少喝咖啡、浓茶等。