毛囊炎脓包破了流脓以后，需要进行相应处理，大致可以分为一般处理、外用药物以及口服药物治疗。患者需要根据不同情况，选择适合的处理方式。
1、一般处理：毛囊炎脓包破了流脓以后，需确保脓液已经全部排出，可以用两根无菌棉签在毛囊炎周围轻轻挤压，帮助脓液排出，可以避免损伤局部皮肤。此操作尽量不私自进行，否则操作不当时，可能导致感染扩散，建议在医生指导下进行。脓液全部排出后，可使用碘伏等对周围皮肤进行适当清洁，保持伤口周围的皮肤处于相对干净的状态；
2、外用药物：局部可以涂抹碘伏进行消毒，可以预防感染，也可以对伤口进行初步处理以后，使用一些具有消炎、抗菌作用的软膏，局部进行抗感染处理，常用的药物包括莫匹罗星软膏、红霉素软膏等；
3、口服药物：如果伤口已经出现了感染，并且导致出现了全身性症状，如全身发热等感染的症状，则需要在医生指导下口服抗生素进行治疗，常用药物包括头孢克肟、伊曲康唑等。