手足口病的疱疹处理方法主要包括消毒隔离、加强饮食、避免摩擦和局部搔抓、药物治疗等，建议前往医院就诊，完善视诊、血常规、血生化检查等。
1、消毒隔离：手足口病是由肠道病毒引起的急性传染病，具有一定的传染性，为避免交叉感染，应隔离至体温正常、皮损消退，一般需要2周。儿童所用物品应彻底消毒，一般用含氯消毒液浸泡及煮沸消毒。不宜蒸煮或浸泡的物品可置于日光下暴晒。
2、加强饮食：儿童应注意休息，多饮温开水，由于手足口病可能会在口腔内出现疱疹，所以儿童以流质饮食为主，并且要清淡、易消化、富含维生素，如小米粥、豆浆等，每次餐后应用温水漱口。对不会漱口的宝宝，可以用棉棒蘸生理盐水轻轻地清洁口腔。
3、避免摩擦和局部搔抓：儿童的衣服、被褥要清洁，衣服要舒适、柔软，宽松、不紧绷，减少皮肤摩擦，经常更换，以免加重皮疹。建议家长剪短儿童的指甲，必要时包裹双手，防止抓破皮肤，诱发感染。
4、药物治疗：口腔出现水疱、糜烂时，可遵医嘱使用西瓜霜、冰硼散等药物吹敷口腔患处。对于手、足等处的水疱，可遵医嘱局部涂抹炉甘石洗剂收敛、止痒，也可以选用冰硼散等药物，用蒸馏水稀释溶化后用消毒棉签蘸涂患处，能够缓解儿童的不适症状。瘙痒明显时还可遵医嘱口服氯雷他定颗粒、盐酸西替利嗪口服溶液等抗组胺药物。如果水疱破裂，还可以在医生指导下局部使用红霉素软膏、莫匹罗星软膏等药物预防感染。
除以上治疗外，还有其他的治疗方法，如发热时可采用温水擦浴、退热贴等方式进行物理降温。家长还要观察儿童居家隔离的精神状态，查看儿童是否退热、水疱或丘疹是否减少。