普伐他汀钠片和阿托伐他汀钙片同属于他汀类降脂药物，但是两种药物在药效强度、服用时间、药物使用限制等方面存在区别，故建议在专业医生指导下选择药物并明确使用方法，不要自行盲目用药，以免药不对症而加重病情。
1、药效强度不同：在人体血脂中对心脑血管不利的是低密度脂蛋白胆固醇、总胆固醇，以及甘油三酯，而高密度脂蛋白胆固醇对于降低总胆固醇具有一定作用。普伐他汀钠片和阿托伐他汀钙片都属于他汀类药物，主要是降低总胆固醇和低密度脂蛋白胆固醇，从而对心脑血管起到一定的保护作用。但是两种药物药效强度会有所不同，阿托伐他汀钙片比普伐他汀钠片对血脂的控制作用强，疗效也更确切，而普伐他汀钠片比较温和，适用于高龄，以及既往服用过阿托伐他汀钙片、瑞舒伐他汀钙片后对肝功能有影响，需要改用普伐他汀钠片的患者；
2、服用时间不同：按照药物说明书，一般建议在临睡前服用普伐他汀钠片，而阿托伐他汀钙片可在一天内任何时间服用，并不受进餐影响，只需要注意确定固定的时间点即可；
3、药物使用限制不同：在应用阿托伐他汀钙片治疗期间，与烟酸 片、环孢素软胶囊、克拉霉素片、伊曲康唑胶囊等药物合用，可增加发生肌病的危险性，而普伐他汀钠片不依赖于肝药酶代谢，在使用过程中受到的限制相对比较少。
在患者使用降脂药物的同时，应当注意定期检测肝肾功能，以免肝脏由于代谢药物而引起功能紊乱。另外，患者应注意限制高脂肪食物的摄入量，多吃新鲜水果和蔬菜，有利于病情的恢复。