早上起来舌头发苦是临床上比较常见的现象，可能是由于生理性原因引起，也可能是由于病理性原因引起，如反流性疾病、神经功能紊乱、口腔疾病等，要根据具体情况进行分析。
一、生理性原因：
通常口腔里有大量的细菌，细菌自身具有新陈代谢的作用，口腔里的食物残渣经过一夜的发酵，容易刺激舌头味蕾感觉苦味的神经末梢，则会有早上起来舌头发苦的情况，通常属于正常的生理性现象，大多数不需要治疗，随着起床以后刷牙、漱口、吃早饭等，舌头发苦的感觉会逐渐缓解。
二、病理性原因：
1、反流性疾病：早上起来舌头发苦可能是由于反流导致，主要反流的物质是酸性物质，如胃酸反流，但在某些情况下，也可能反流碱性物质，常见于胆汁反流，包括胆囊切除或者十二指肠蠕动功能障碍的患者，导致十二指肠内的胆汁逆蠕动到胃及食道，进而反流到口腔，导致早上起来舌头发苦；
2、神经功能紊乱：可能是由于生活、工作压力较大，存在长期睡眠不足等情况，导致神经功能紊乱，继而出现早上起来舌头发苦的症状；
3、口腔疾病：当口腔卫生出现问题时，可能会引起龋齿、牙周病等情况，容易导致局部细菌滋生，可能导致口臭、口苦等口腔异味。
出现早上起来舌头发苦的情况时，在平时应保持良好的生活习惯，避免暴饮暴食，每餐保持七分饱即可，在吃饭时不要出现过于撑胀的感觉，吃完饭30分钟之内不要马上躺下，建议适当进行体育活动，刺激胃肠蠕动，有利于食物的消化、吸收。也可以使用漱口水漱口，注意保持口腔卫生，能够缓解早上起来舌头发苦的情况。