感冒发烧39℃，通常可以吃退烧药治疗，还可以配合医生吃感冒药治疗，也可以根据情况吃抗菌药或抗病毒药治疗，但患者注意在使用任何药物时均需要遵医嘱用药，降低药物的不良反应。
一、对症治疗药：
1、退烧药：感冒发烧39℃时若症状比较严重，需要配合医生吃退烧药进行退烧治疗，如吃布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚胶囊等，通常能够起到解热镇痛的作用；
2、感冒药：在出现感冒发烧39℃的现象后，可以吃感冒药治疗感冒，如果是风热感冒，可以吃银翘解毒丸、桑菊感冒片等药物，如果是风寒感冒，可以吃感冒清热颗粒等药物，有助于缓解感冒引起的头痛、发热、鼻塞、流鼻涕等症状。
二、对因治疗药：
1、抗菌药：感冒发烧39℃可能是由细菌感染所致，可以吃抗菌药治疗，如阿莫西林胶囊、头孢克肟分散片等，能够起到消炎抗菌的作用；
2、抗病毒药：感冒发烧39℃可能是病毒感染所致，通常具有自愈性，但症状严重时也可以吃抗病毒药治疗，如利巴韦林颗粒、磷酸奥司他韦胶囊等。
感冒发烧39℃时除了药物治疗外，还可以采取物理降温治疗，如贴退热贴、温水擦浴等， 在治疗期间注意清淡饮食，还可以多饮水，促进机体新陈代谢，帮助身体恢复。