儿童每天凌晨三四点咳嗽，可能是非疾病因素导致的，如呼吸道干燥、受凉，也可能是过敏性咳嗽、喘息性支气管炎或咳嗽变异性哮喘等疾病因素引起的，此时应在专业医生指导下给予正确治疗。
一、非疾病因素：
1、呼吸道干燥：可能为儿童睡前喝水较少，并且张口呼吸，由于在睡眠过程中口腔内的液体会不断蒸发，可能会在凌晨三四点时由于呼吸道黏膜干燥，出现刺激性咳嗽症状。此时应注意保持室内湿度适宜，并且纠正宝宝张口呼吸的不良习惯；
2、受凉：凌晨室内温度相对较低，儿童可能会出现受凉的情况，引起呼吸道收缩、痉挛，容易出现咳嗽症状，此时需要注意夜间保暖，有助于减少咳嗽症状。
二、疾病因素：
1、过敏性咳嗽：病因不明，常在吸入花粉、动物毛发等物质后诱发，可使呼吸道出现过敏反应，表现为刺激性干咳，可在夜间或白天出现，严重时会引起失眠，此时可遵医嘱给予醋酸地塞米松片等药物进行抗炎、止咳治疗；
2、喘息性支气管炎：若儿童呼吸道受到病毒侵袭，尤其为呼吸道合胞病毒，多会引起呼吸道黏膜充血、水肿，从而出现干咳症状，可能为凌晨出现，还会伴随发热和喘息。家长可选择给儿童使用吸入用布地奈德混悬液雾化吸入排痰，严重时可选择使用利巴韦林颗粒进行抗病毒治疗；
3、咳嗽变异性哮喘：可能为儿童在夜间睡觉时，吸入过敏物质，如花粉、尘螨等，多会引起呼吸道过敏反应，可能会出现干咳症状，一般不会伴随喘息、胸闷等不适症状，此时可给予吸入用硫酸沙丁胺醇溶液或吸入用布地奈德混悬液等药物来缓解支气管痉挛。
除上述因素外，还可能为胃食管反流导致，若儿童长时间存在上述症状时，家长应及时带儿童到医院小儿呼吸科就诊、治疗。