消化系统穿孔手术成功率是否高，取决于消化系统穿孔的原因、时间和穿孔的严重程度，以及患者自身身体状况等多个因素。无法一概而论，需综合以上因素共同分析判断。
1、成功率较高：一般情况下，消化系统穿孔多指胃、十二指肠溃疡伴穿孔，或小肠、结肠由于外伤引起穿孔等。如果患者自身身体状况较好，且胃、十二指肠溃疡伴穿孔的时间较短时，此时积极通过腹腔镜微创手术，或传统开腹手术等手术治疗后，可得到相应恢复，且手术成功率较高；
2、成功率较低：当患者消化系统穿孔时间较长时，由于胃肠道内容物大量外露，出现腹腔感染时，手术难度相对增大，所以成功率可能有所降低。另外，对于肿瘤性穿孔，如胃癌引起的穿孔，由于恶性肿瘤的不断侵袭与扩散，即使已经成功修复穿孔，但仍可能出现癌细胞的二次侵袭，所以手术成功率相对较低，患者的预后较差。