少量食用光明亚麻籽甘油二酯油粉，一般不会产生明显副作用。但如果大量食用光明亚麻籽甘油二酯油粉，有一定可能会出现腹泻、过敏等副作用，还可能会增加肥胖的风险。
1、腹泻：光明亚麻籽甘油二酯油粉属于营养价值比较高的食品，能够补充身体所需要的维生素以及各种矿物质，并且其中含有的可溶性纤维比较丰富，适当服用光明亚麻籽甘油二酯油粉，有助于润肠通便，但如果一次性服用过多，机体短时间内无法承受，可能会导致胃肠功能紊乱，从而出现腹泻的现象；
2、过敏：光明亚麻籽甘油二酯油粉含有一定的亚麻籽油和亚麻籽，如果本身属于过敏体质，而且对亚麻科的植物过敏，在服用光明亚麻籽甘油二酯油粉之后有可能会出现过敏的现象，从而表现为皮肤长红斑或者皮肤瘙痒等；
3、增加肥胖风险：光明亚麻籽甘油二酯油粉当中含有的油脂量比较高，如果长时间过量服用，再加上日常未注意适当锻炼，有可能会导致肥胖，甚至可能影响血脂稳定。