肝硬化的病理三个特征包括广泛肝细胞变性坏死、纤维组织增生和肝细胞结节状再生，导致肝小叶被破坏，假小叶形成。虽然假小叶内包含有再生的肝细胞，但是由于排列的结构是紊乱的，也同时存在不同程度的变性甚至坏死，所以并不具备肝小叶的生理功能，表现为肝功能减退。弥漫的纤维化包绕再生结节形成岛屿样结构，肝脏硬度逐渐增高，形成肝硬化。
1、广泛肝细胞变性坏死：一种或多种致病因素长期或反复作用于肝脏．引起肝实质弥漫性损害．使肝细胞出现变性、坏死及炎症性反应，导致肝脏功能减退；
2、纤维组织增生：由于肝脏出现了病理反应，肝被膜会增厚，表面会出现纤维组织增生；
3、肝细胞结节状再生：当病变导致肝细胞坏死时，附近的细胞可进行再生修复，若是肝细胞受损严重，再生时易导致排列的结构是紊乱，出现肝结节。肝脏的切面可见多数圆形结节，呈黄绿色，弥散分布，结节被增生的纤维组织包围，破坏肝小叶的正常结构，使肝功能受损。
肝硬化的发生通常是由于3个病理特征反复作用，导致肝小叶受损以及肝内血管被重建改变，使肝脏体积变小变硬形成了肝硬化。