牙髓摘除术属于根管治疗的其中一项内容，并且牙髓摘除术可以进行局部摘除，而根管治疗通常需要全部摘除。所以牙髓摘除术与根管治疗的区别，在于适用范围不同、摘除范围不同等。
1、适用范围不同：牙髓摘除术以后可以进行塑化治疗，不一定需要进行根管治疗。但根管治疗是在牙髓摘除术后，根管预备并进行根管充填。牙髓摘除术属于根管治疗的一个步骤，根管治疗能比较彻底治疗牙髓炎，以及牙体组织疾病；
2、摘除范围不同：牙髓摘除术以后，不一定会对根管进行相应的预备，而且牙髓摘除术可以是部分摘除，也可以是全部摘除。根管治疗是将牙髓彻底全部摘除去除，并且需要清创。不仅要将牙髓全部摘除，而且要将盛放牙髓的根管边缘以及根管壁进行预备，将根管壁周围进行扩管，扩成比较规则的形状。