睡醒后肚子酸疼可能是腹部受凉、胃肠功能紊乱或慢性膀胱炎等原因导致的，若症状持续不能缓解，建议及时就医，查明病因后进行针对性治疗。
1、腹部受凉：腹部受凉后肠蠕动增加，可出现睡醒后肚子疼的症状。此时适当进行按摩、热敷可缓解疼痛，平时应尽量注意腹部保暖，及时添加衣物；
2、胃肠功能紊乱：通常是因进食不当或细菌感染等因素导致的胃肠黏膜损伤，可引起肠道痉挛或扩张，进而诱发疼痛。建议及时就医，可在医生的指导下服用颠茄片、双歧杆菌乳杆菌三联活菌片等药物进行治疗；
3、慢性膀胱炎：可能是细菌、病毒感染引起的，可出现肚子酸疼的现象，并伴有尿频、尿急、尿痛、血尿等症状。可在医生指导下服用阿奇霉素分散片、盐酸左氧氟沙星胶囊等药物进行治疗。
此外女性月经来潮、肠炎以及结肠肿瘤、直肠肿瘤等情况，也可能引起上述症状。月经期间肚子酸疼的人群，可在医生指导下服用布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等药物治疗，肿瘤患者多需通过手术切除来进行治疗。