卡介苗在临床中通常分为免疫用卡介苗和治疗用卡介苗，免疫用卡介苗可以分为皮内注射和皮下划痕法，不同的方法其注射方法、部位角度都有所不同，患者可以在医生的帮助下使用卡介苗。
一、免疫用卡介苗：
1、皮内注射：需要在上臂外侧三角肌中部略下处皮内注射，进针角度与皮肤呈5°角，皮内注射用卡介苗的主要成分为卡介苗活菌体，注射后可使机体产生细胞免疫应答。
2、皮下划痕法：需要在左上臂三角肌下端外缘，用酒精消毒皮肤，待皮肤干燥后，滴2-3滴摇匀的菌苗液，用消毒的针在局部划“井”字形，各长1-1.5厘米，间隙0.5厘米，以出现红痕为宜。之后需涂匀菌苗，使其渗入皮内，菌苗干后才可穿衣服，该方法不存在进针角度。
二、治疗用卡介苗：
治疗用卡介苗临床用于治疗膀胱原位癌和预防复发，主要方法为将导尿管插入膀胱腔，然后将稀释好的药液经导尿管注入。注入后，患者不断变换体位，如左侧、右侧、仰卧和俯卧，各约30分钟，经2小时后自行排出药液。
需要注意的是，对卡介苗成分过敏的人群严禁使用，如果注射后身体出现持续发热等不适现象，需及时 与医生沟通，遵医嘱进行干预治疗。