阴囊瘙痒是否可以用莫匹罗星软膏需根据病情而定。莫匹罗星软膏是外用的抗生素，通常可用于治疗毛囊炎、湿疹等敏感菌感染造成的疾病。如只是单纯瘙痒可以使用止痒药物，对于伴有炎症反应者，可使用此药物来消炎处理。
阴囊瘙痒可能是由于阴囊湿疹所致，此疾病会累及肛门周围或阴茎等部位出现瘙痒等症状。如果病情轻微，只有瘙痒而无其他炎症性反应，一般不使用莫匹罗星软膏，而是使用止痒药物，如炉甘石洗剂或者口服抗过敏药物治疗，如氯雷他定或扑尔敏等；如果局部发生感染，出现炎症反应，伴有疼痛、发红、脓肿等症状，可选择莫匹罗星软膏改善。
此外，阴囊瘙痒还可能是念珠菌感染、疥疮、过敏性皮炎等疾病导致，这些疾病都不是细菌感染引起，使用莫匹罗星软膏效果有限，一般不建议时使用该药治疗。
由于莫匹罗星属于抗生素，其成分为莫匹罗星，含有聚乙二醇，大面积使用后可能会对身体有一定的影响，造成肾损害。因此大面积皮损或患有肾脏疾病者，要避免长时间、大面积使用；过敏体质者和哺乳期女性慎用，以防止对身体造成不利影响。建议在医生指导下使用，避免盲目使用，以防止对身体造成不利 影响。