肌酸激酶同工酶临床诊断中有十分重要的意义，而导致新生儿肌酸激酶同工酶偏高的原因有很多，包括生理性原因和病理性原因，需根据具体情况进行鉴别。
一、生理性原因：
1、分娩出生：一般在分娩出生后，新生儿血清肌酸激酶同工酶可能会偏高于正常值，属于新生儿期的正常情况；
2、活动增多：新生儿在出生后如果活动明显增多，哭闹时间较长，或者经历比较剧烈的分娩过程，均可能造成一过性肌酸激酶同工酶增高的现象。
二、病理性原因：
1、机体发育延迟：如果母亲怀孕期间存在营养不良，或者母体本身存在营养缺乏，可能会造成新生儿的机体发育迟缓，继而导致新生儿肌酸激酶同工酶增高；
2、心肌受损：新生儿在出生时，如果存在缺氧或缺血现象，可能会造成心肌受损，此时可以出现肌酸激酶同工酶增高的现象。另外，如果新生儿存在病毒性心肌炎、呼吸道感染、腹泻、发热等病毒感染性疾病，使心肌细胞受到了病毒感染，继而出现心肌受损，此时也会出现新生儿肌酸激酶同工酶偏高的情况；
3、药物副作用：部分药物的使用也会引起肌酸激酶同工酶增加，如母亲在分娩时使用的麻醉剂、抗生素、激素等，如青霉素类抗生素、糖皮质激素等，包括氨苄西林胶囊、醋酸泼尼松片等，均可能造成新生儿肌酸激酶同工酶偏高；
4、脑血管疾病：如果为脑型肌酸激酶同工酶偏高，常提示新生儿发生脑血管疾病，主要是由于脑型的肌酸激酶同工酶存在于脑细胞当中，一旦发生脑血管疾病，会相应导致新生儿肌酸激酶同工酶偏高；
5、其他疾病：如果新生儿出现比较严重的肌营养不良等情况，也会导致新生儿肌酸激酶同工酶增高的现象。
新生儿出现肌酸激酶同工酶偏高时，不要过于紧张，应注意观察新生儿的一般状态，分析临床表现及病史。如果数值逐渐下降，通常属于生理性偏高，不用过于担心，会自行慢慢缓解。如果确实存在疾病原因造成新生儿肌酸激酶同工酶增高，则应及时给予相应药物进行干预和治疗。