夜里头疼，白天慢慢消失，可能是由于休息不佳、植物神经功能紊乱、睡眠呼吸暂停综合征、颈椎病、丛集性头痛、颅内病变所引起的。如果这种情况经常出现，建议就医明确诊断并进行治疗。
1、休息不佳：比如睡觉前思虑过多或过度兴奋，或饮用了咖啡、浓茶等，可导致夜间睡眠不佳，大脑得不到充分休息，白天得到休息补充，就可能出现夜里头疼但在白天慢慢消失的情况；
2、植物神经功能紊乱：通常是由于长期精神心理创伤或者是生活作息不良等原因所引起的，比如精神长期紧张、心理压力过大等，可导致植物神经功能紊乱，就可能会表现出上述症状；
3、睡眠呼吸暂停综合征：患者夜里睡觉时由于疾病因素，导致通气不足，机体缺氧，尤其是脑组织，还可影响睡眠、休息，进而出现夜里头疼、白天好转的情况；
4、颈椎病：该病患者在夜里睡觉时如果枕头过高或者是睡眠姿势不当，容易导致颈部肌肉紧张、痉挛，对局部血管造成压迫，致使椎基底动脉供血不足，脑组织缺氧就会引起夜里头疼，而白天适当活动后，使颈部肌肉逐渐放松，脑血供恢复，头疼症状就会慢慢消失；
5、丛 集性头痛：该病属于三叉神经性自主神经性头痛，具有周期性发作的特性，尤其在晚上频发，还可能会伴有眼眶疼痛、情绪烦躁等症状；
6、颅内病变：常见于脑肿瘤、脑梗死、脑水肿等疾病，因患者白天大多情况下处于站立位，而晚上睡觉时因体位发生变化容易引起颅内压相对增高，就可能会造成夜里头疼的现象。