确诊狂犬病病毒感染较好的方法有病毒分离、病原检测、核酸检测、抗体检测、核磁共振等。狂犬病病毒最初进入伤口时不进入血液循环，而是在被咬的肌肉组织中复制，然后进入神经系统。因此狂犬病潜伏期时一般无法检测到狂犬病病毒，通常在发病期或死亡后才可检测到病毒的存在。
1、病毒分离：检测标本适合脑组织和唾液，由于脑组织难以获取，也可采取脑脊液进行病毒分离检测。通常唾液的分离率高于脑脊液；
2、病原检测：采取标本为脑组织和颈后部皮肤毛囊样本，可进行免疫荧光抗体试验，快速免疫组化法、酶联免疫法，其阳性结果可作为诊断依据；
3、核酸检测：标本为唾液、脑组织、脑脊液。核酸检测是检查狂犬病的重要方式，主要是采用PCR法，能够测定体内的RNA。核酸测定检测项目检出狂犬病的阳性率相对较高；
4、抗体检测：标本为血清、脑脊液样本。对于未接种过狂犬病疫苗的患者，其狂犬病病毒综合抗体检测阳性可作为诊断的依据；
5、核磁共振：无论是何种临床症状，当脑干、海马、下丘脑、深层和皮层下白质以及深层和皮质灰质的MRIT2成像出现模糊、微弱的异常高信号时，均提示可能有狂犬病。疾病晚期进入昏迷状态时，增强磁共振可清楚显示上述改变。这些特征可用来将狂犬病与其他病毒性脑炎进行区分。
狂犬病病毒无法在潜伏期查到，进入发病期时即使查到病毒也无有效的治疗手段。因此一旦发生狂犬病病毒暴露，应尽早接种狂犬疫苗预防感染。