NT做完以后绝大多数孕妇已经进入到了孕中期，大约在14周之后，下次检查的项目根据不同的月经周期、年龄，以及既往是否有不良孕产史，是否曾经有过生育异常或者染色体疾病的胎儿，是否有一些异常的家族史等进行综合的判断。如果没有任何的高危因素，孕妇本身的年龄到预产期的时候小于35岁，下一次检查通常会选取在怀孕16-17周做唐氏综合征的筛查，除此之外，还要继续孕期常规检查。
唐氏综合征的筛查是在怀孕中期进行血清生化学的检查，需要孕妇抽取外周静脉血检查血液中的甲胎蛋白、游离雌三醇，以及β人绒毛膜促性腺激素等生化学的指标。再借助计算机将孕妇的年龄、种族、孕周、体重，以及既往是否有特殊的不良孕产史，是否为需要注射胰岛素的糖尿病患者等诸多影响因素代入到软件中，计算出胎儿是否患有18-三体综合征、21-三体综合征、13-三体综合征以及开放性脊柱裂的风险值。如果计算出来属于高危，需要尽快的完成下一步的检查。
还有一些女性由于本身高龄，或者是由于既往的不良孕产史，还有由于孕周计算出现比较大的误差，并不合适进行唐氏综合征的筛查，通常会建议进行无创DNA的检查，同样也是抽取外周静脉血，可 以直接采集胎儿的游离DNA，进行胎儿染色体的相关疾病筛查。
但要注意，无创DNA的检查没有办法筛查胎儿的开放性脊柱裂，所以在进行无创DNA的检查时，还会进行甲胎蛋白的生化学指标检测。如果这个数值异常升高，就需要在19-20周的时候，通过超声检查进一步排查胎儿的开放性的脊柱裂。