需氧菌感染一般是指需氧菌导致的感染性疾病。需氧菌通常指需要在有氧的环境当中才能生长繁殖的细菌，与之对应的是厌氧菌，厌氧菌需要在无氧的环境中生存。
临床上根据细菌生长繁殖的过程中是否需要氧气可以分为两大类，分别是需氧菌以及厌氧菌。所谓的需氧菌就是指细菌在生长繁殖的过程中需要氧气供应，在无氧的环境当中可能不容易生存。如果是需氧的细菌导致人体出现的感染，就称为需氧菌感染，常见的包括结核分枝杆菌、铜绿假单胞菌等，可能会导致患者出现肺结核、阴道炎等疾病。
相反，厌氧菌的生存条件不需要氧气，在缺乏氧气的环境当中才能够生存繁殖。厌氧细菌导致人体出现感染，就称为厌氧菌感染，包括乳酸杆菌、月形单胞菌等，可能会导致患者出现上呼吸道感染和胸腔内感染等疾病。
需氧菌感染相对来讲做培养的时候更容易被查到，因为常规的培养方法是在有氧的环境当中进行。而厌氧菌感染通过常规培养通常查不到，需要用专门的厌氧菌培养的方法进行培养。