儿童康复科主要治疗的内容包括儿童神经系统损伤康复、运动系统损伤康复以及心理疾病恢复。儿童康复科指是通过各种医学手段和方法，改善患儿的运动功能以及生活自理能力，并缓解心理问题的科室。
1、神经系统损伤康复：儿童康复科主要可以恢复儿童的神经系统损伤，包括脑瘫、智力低下、癫痫等。可以针对儿童开展语言训练、智力训练等，对有语言障碍的儿童，开展语言训练，如让其多听、多模仿说话、多发声等，训练儿童对外界感知觉能力，让儿童识字、识图，提高记忆能力。通过训练逐渐使儿童的运动功能得到改善，并提高语言能力；
2、运动系统损伤康复：包括由各种疾病引起的运动功能障碍，如由于损伤所致的肢体损伤，如骨折、脊柱损伤等。通常儿童在神经系统损伤的同时，伴有肢体功能障碍，所以需要进行肢体训练，包括肌肉训练、运功功能锻炼等。儿童通常需要被动进行损伤部位的功能锻炼，如果是上肢损伤，可以通过伸指、屈指进行锻炼，如果是下肢骨折，可以进行等长收缩训练，指导儿童收缩腿部肌肉后再放松，防止肌肉萎缩；
3、心理疾病恢复：儿童心理疾病包括自闭症、多动综合征 、抑郁症等，主要康复方法包括经典的心理分析疗法、简易精神疗法、关系疗法、游戏疗法等。可以减轻儿童不良的情绪，减少不良行为习惯的发生，改善儿童的精神状态。
儿童康复科不仅可以改善儿童身体的运动和感知觉能力，而且可以让儿童学习日常生活和社会生活技巧。患儿及家长应树立康复的信心，减轻焦虑心理，可与医生学习简单的家庭训练，并应带患儿定期复查。