用黄体酮凝胶排出褐色分泌物可能由于阴道黏膜出血、药物过敏、宫颈出血、月经来潮、先兆流产等原因导致，建议及时停药，前往医院查明原因，进行针对性处理。
1、阴道黏膜出血：如果黄体酮凝胶放入阴道时过于用力，可能会导致阴道黏膜损伤、出血，而少量出血可以造成阴道排出褐色分泌物。建议用药时动作轻柔，可以避免此现象出现；
2、药物过敏：黄体酮凝胶主要成分为黄体酮，赋形剂有液体石蜡、甘油、山梨酸等，可能部分女性对此类药物成分过敏，导致阴道发生过敏反应，表现为水肿、出血等症状，造成褐色分泌物排出。需要及时停止用药，症状严重者需要遵医嘱口服苯海拉明片、盐酸西替利嗪片等药物进行抗过敏治疗；
3、宫颈出血：如果患者患有宫颈炎、宫颈息肉等疾病，宫颈管内口或宫颈息肉会充血水肿，放置黄体酮凝胶时触碰可以引起宫颈出血，出现阴道排出褐色分泌物。需要停用黄体酮凝胶，改用黄体酮肌肉注射、口服黄体酮胶囊等方式治疗，可以缓解症状；
4、月经来潮：黄体酮凝胶主要用于补充孕激素，使用黄体酮凝胶期间，月经来潮可以引起阴道排出褐色分泌物。此时一般不用担心，如果确认为月经来潮，及时停止使用黄体酮凝胶即可；
5、先兆流产：黄体酮凝胶可以用于黄体酮缺乏引起的先兆流产，而先兆流产症状表现为阴道出血，多为暗红色，血性分泌物等。使用黄体酮凝胶后阴道出血未控制时，或者再次出现阴道血性分泌物时，可以在黄体酮凝胶使用期间排出褐色分泌物。一般建议口服黄体酮胶囊、地屈孕酮片，或者肌肉注射黄体酮继续补充孕激素治疗。