一般情况下，碘伏开启后置于阴凉干燥处保存有效期为7天左右，但如果频繁使用时，由于碘易挥发, 开口贮藏时溶液浓度下降明显，有效期可适当缩短至3-5天，甚至24小时。如果是保存良好，严格按照无菌要求使用的大瓶碘伏，其有效期可适当延长至10天。
在临床上，因小瓶碘伏反复蘸取使用，为保证消毒效果，一般开封后有效期为24小时。家庭使用的碘伏，由于使用频率少，环境没有医院复杂，因此在严格无菌操作的前提下，可增加有效期至7天左右。需注意小瓶碘伏在使用过程中，不要把已经污染的棉球、棉签，再次插入碘伏瓶内蘸取碘伏，避免导致碘伏出现污染。大瓶的碘伏通常倒在无菌容器中使用，且未用完的碘伏不能再倒回去，使用后及时封口，不存在开封后反复蘸取的情况，有效期可为10天，但如存在反复蘸取情况时，有效期等同小瓶碘伏。
每次使用完碘伏以后，建议及时将碘伏盖子盖好，以免细菌入侵或液体挥发。并且需要将碘伏放置在阴凉、避光、干燥处，建议保存温度在20℃以下，才能更好地防止药物过早失效。