蘑菇和灵芝都属于真菌类，但灵芝和蘑菇之间存在区别，通常包括性味归经及功效不同、药用价值不同等方面，建议在使用灵芝之前遵循专业医师，避免自行盲目使用。
1、性味归经及功效不同：灵芝是一种中药材，为多孔菌科灵芝属真菌赤芝或紫芝的干燥子实体，其味甘、性平，归心、肺、肝经，具有补气、安神以及止咳平喘的功效。蘑菇为红菇科真菌沥青色乳菇的子实体，其味辛、甘、性温，具有祛风散寒以及舒筋活络的功效；
2、药用价值不同：灵芝通常可用于治疗气血不足和心神失养所导致的心神不宁、失眠、惊悸多梦、健忘以及食少等症状，能够起到补心血、益心气、安心神的作用。患有形寒咳嗽、痰多气喘的患者，服用灵芝后能够起到补益肺气、温肺化痰以及止咳平喘的治疗效果，同时灵芝可以改善虚劳短气、不思饮食或烦躁口干等症状，能够起到较好补气养血的作用。蘑菇的药用价值不高，通常是作为一种日常蔬菜食用，也可用于改善风湿引起的痹痛、四肢麻木以及手足抽搐等症状。