深呼吸的时候右肋骨里面疼可能是由肋间肌肉劳损、胸膜炎、肋软骨炎、胆结石、肋骨骨折等原因引起，建议及时就医，采取药物治疗、物理治疗等方法进行治疗。
1、肋间肌肉劳损：剧烈运动、大幅度活动等会导致局部的软组织和韧带受到挤压、牵拉，出现肌肉劳损，造成局部疼痛、肿胀等症状。可以在医生的指导下使用双氯芬酸钠缓释片、布洛芬缓释胶囊等非甾体类抗炎药缓解疼痛，并注意休息，避免加重症状；
2、胸膜炎：肺炎、肺癌、结核病等疾病会诱发壁层胸膜的炎症，炎性刺激会引起右肋骨里面痛的症状，并伴有胸闷、气急等。建议患者采取患侧卧位休息，如果症状严重，可以采取机械性胸膜摩擦术、开胸手术等手术进行治疗；
3、肋软骨炎：病毒感染、劳损、外力撞击等会诱发肋软骨炎，如果长期累及肋软骨部位，会造成胸痛、局部肿块等症状。可以在医生指导下使用局部热敷、烤电等物理治疗的方法缓解症状，还可采用肋间神经封闭治疗；
4、胆结石：胆汁排空延迟造成胆汁淤积，可能会形成胆结石，胆结石在胆囊内可刺激胆囊黏膜，诱发疼痛症状，发生嵌顿之后可以加剧疼痛。患者应避免食用高胆固醇、高脂肪的食物，可以遵医嘱使用消石利胆胶囊、利胆排石片等药物进行治疗；
5、肋骨骨折：直接暴力、间接暴力作用于胸部时，不仅会导致软组织损伤，还可能会导致肋骨骨折，患者会出现局部疼痛，呼吸时由于胸廓活动，疼痛症状会加重，还可能会伴有呼吸受限。建议及时清理呼吸道分泌物，并使用多条胸布固定或弹力胸带等固定胸廓，必要时进行切开复位内固定术、人工骨植入术等手术治疗。
如果患者长期出现这种情况，应尽快完善X线片、CT、胸腔镜等检查，以明确诊断，以免造成严重后果。