每天早上起来喉咙有痰可由多种情况引起，常见的有慢性咽部炎症、鼻部疾病、慢性支气管炎和胃食管反流，应就医检查血常规、咽喉镜、24小时反流检测等确诊，明确病因后治疗。
1、慢性咽部炎症：常见为慢性咽炎或扁桃体炎，在夜间由于咽喉黏膜长期受炎症刺激产生分泌物，导致早上起来喉咙里有痰的现象，常伴有咽干、咽部异物等症状。可以含服薄荷含片或用复方硼砂溶液漱口，多数病人在1-2周的时间内，症状会逐渐缓解；
2、鼻部疾病：如果发生鼻部炎症，如鼻炎、鼻窦炎，鼻腔分泌物在睡觉时会倒流到咽喉，导致早上起来有清痰或黄痰的症状。常伴有鼻塞、鼻痒等症状，可以应用激素类药物喷鼻，并用生理盐水进行鼻腔冲洗。等鼻炎、鼻窦炎好转后，这种症状也会消失；如果发生鼻部结构组织异常，如鼻息肉、鼻中隔偏曲，会引起病人鼻塞，需要经口呼吸，甚至引起打鼾，通常会刺激咽喉，导致睡眠过程中有分泌物，引起早上起来有痰的现象，应就医检查鼻腔，必要时手术治疗；
3、慢性支气管炎：咳嗽、咳痰症状一般表现为晨间较重，白天较轻，临睡前有慢性阵咳或排痰，为白色黏液性或浆液性痰，合并感染时则为黏液脓性或脓性痰，偶尔带血痰。要控制感染，遵医嘱给予左氧氟沙星、阿莫西林等抗生素，同时配合给予镇咳祛痰药物如右美沙芬、复方甘草合剂，以及平喘药如支气管扩张剂等药物，可使咳嗽、咳痰症状缓解；
4、胃食管反流：夜间病人平躺时，胃酸容易反流到咽喉，使咽喉产生分泌物，出现早上喉咙有痰的症状，常伴有烧心、恶心等症状，应检查胃镜和24小时反流检测等确诊，遵医嘱给予奥美拉唑、莫沙必利等抑酸、促进胃动力药物治疗。