脸颊颧骨两边发酸可能是长时间咀嚼导致，还有可能是病理性的原因，比如颞颌关节炎、磨牙、面神经麻痹、三叉神经痛以及面神经炎等。建议此时前往医院进行鉴别诊断，以免延误病情。
1、长期咀嚼：如果在平时的生活中，经常吃比较坚硬和粗糙的食物，比如牛肉干和槟榔，容易导致咀嚼肌过度活动，从而出现脸颊颧骨两边发酸的症状，需要改变饮食结构，减少此类食物的摄入；
2、颞颌关节炎：颞颌关节炎的发生与咬合紊乱、创伤和精神因素有关，容易导致下颌运动障碍、关节弹响和关节区疼痛，也会产生脸颊颧骨发酸症状。可以遵医嘱使用硫酸氨基葡萄糖胶囊，或者服用非甾体类抗炎药治疗，如阿司匹林片、对乙酰氨基酚片，能够消除炎症；
3、磨牙：如果经常在夜间睡觉的时候磨牙，容易导致咬合性创伤，还会产生牙槽骨增生的症状，从而引起唇颊侧骨突起呈结节状，也容易在晨起的时候感觉到颌面部肌肉紧张和疲乏，从而产生脸颊，颧骨两边发酸的症状。可以在夜间睡觉的时候使用咬合板，能够阻断磨牙，减轻肌肉紧张度；
4、面神经麻痹：面神经麻痹与受风寒刺激有关，会导致局部皮肤痉挛也会引起肿胀，从而导致脸颊颧骨两边发酸。可以采取针灸的方式治疗，以及用手按摩面瘫肌肉，能够一定程度上缓解疼痛；
5、三叉神经痛：三叉神经痛属于一种脑神经疾病，发病的原因比较复杂，在发作的时候会导致脸部出现阵发性剧烈疼痛，出现脸颊、颧骨两边发酸的情况，需要使用卡马西平片或苯妥英钠片治疗；
6、面神经炎：面神经炎的发生与病毒感染有关，可能会导致毛细血管扩张，也容易引起组织水肿压迫，若产生了缺血的恶性循环，容易导致脸颊颧骨两边发酸。一般需要使用营养神经的药物治疗，比如维生素B1、甲钴胺片。