点痣的药水对人体健康通常没有危害，但其含有强碱和强酸成分和少量的化学成分，如果在使用药水点痣的过程中操作不当，有可能会导致皮肤损害，甚至留下疤痕。
药水点痣主要是通过化学腐蚀的方法来腐蚀色素痣，其腐蚀深度不易掌握。如果腐蚀表皮比较浅，痣不会彻底脱落。如果使用药水较多，腐蚀比较深，会对皮肤产生一定的刺激，导致疼痛、红肿等症状，严重者甚至出现皮肤损伤，留下明显的疤痕，因此该方法目前在临床上应用比较少。黑色痣体积比较小的人群，如果选择药水点痣，应尽量寻求专业人士的帮助，这样可以控制好药水的剂量，有利于避免副作用的发生。
如果痣的体积比较偏大，药水点痣治疗的效果较差，尤其表皮深层的痣效果不明显，可以选择激光点痣的方法改善。该方法主要通过瞬间爆发出来的一种聚积高热能量，直接穿透到皮肤最深层，可以把皮下的色素颗粒分解成比较细小的颗粒，随着皮肤新陈代谢排出体外，从而达到祛痣的效果。