头孢即头孢菌素类药物，毒性低，副作用较少，常见如皮疹、发热等过敏反应，但较青霉素类少见，尤其是过敏性休克。肌注可引起局部疼痛，常需与利多卡因混合注射。口服制剂常可引起胃肠道反应，此外，偶可引起血清氨基转移酶增高等。
1、第一代注射用头孢菌素如头孢噻吩、头孢唑林有潜在肾毒性，应避免剂量过大，与其他肾毒性药物如氨基糖苷类、万古霉素、速效利尿剂联合应用时需注意观察肾功能；
2、用药期间饮酒可引起乙醛中毒反应，表现为发热、面色潮红、心慌、胸闷、视觉模糊、头痛、恶心、呕吐、心动过速、血压下降、烦躁不安等，严重可发生呼吸抑制、心肌梗死、急性心衰等，并可导致休克甚至死亡，严重程度与用药剂量和饮酒量成正比，故12小时内有饮酒史或饮用含乙醇成分的饮料、药物者，宜暂缓使用。用药期间及停药后1周内应避免饮酒、避免摄入含乙醇的饮料和食物，禁止口服或静脉输入含乙醇的药物；
3、腹泻亦可发生，尤以应用头孢哌酮时多见，偶见二重感染和假膜性肠炎；
4、大剂量应用偶可发生抽搐等中枢神经系统反应。
因此，用药前须详细询问有无对头孢菌素类、青霉素类或其他药物过敏史。有青霉素类、其他β内酰胺类(如单环β内酰胺类、碳青霉烯类和头霉素类等)以及其他药物过敏史者，有明确应用指征时应慎用。在用药过程中一旦发生过敏反应须立即停药，如发生过敏性休克应立即抢救，并给予肾上腺素、糖皮质激素等相关抗休克治疗。