用了咪喹莫特后疣体变大，通常考虑咪喹莫特引起免疫反应，或咪喹莫特治疗无效、诊断有误等导致。通常建议患者尽快复诊，并根据医生建议调整治疗方案。
咪喹莫特为免疫激活剂，局部使用后可激活受体，并间接刺激适应性免疫应答，最终依靠免疫清除，将感染人乳头瘤病毒所引起的尖锐湿疣治愈。这个过程中，免疫应答过程可以导致局部炎症，引起血管扩张、水肿等，以致外观上疣体变大。咪喹莫特对尖锐湿疣整体有效率较高，但并不是所有人使用咪喹莫特都可以实现治愈，对于部分人群，由于治疗无效，也可能导致疾病继续进展，出现疣体变大。
对于非感染性疾病，咪喹莫特并不一定具有治疗作用，反而可能因为局部刺激而引起水肿等问题，导致赘生物变大。因此，咪喹莫特治疗过程中如果未见好转，或治疗过程中出现疾病进展，以及溃疡、肿痛等不良反应，建议尽早复诊，并对因治疗。