甲状腺囊肿是否会自己好，需要根据具体情况进行判断，往往无法一概而论。建议患者及时就医，在医生指导下根据具体情况进行针对性处理。
1、会：甲状腺囊肿产生的原因，多是由于患者身体吸收的碘量不足，引起碘的绝对或相对不足，导致甲状腺激素合成障碍，使血液中的甲状腺激素浓度降低，使甲状腺组织发生代偿性增生、肥大等病变，进而发展成囊肿。当甲状腺囊肿极小时，少数患者通过补充碘剂，可以改善甲状腺激素合成障碍的现象，因此这类甲状腺囊肿自己会好；
2、不会：在甲状腺肿大的初期，扩张的滤泡分布较均匀地散布在腺体内部周围，形成弥漫性甲状腺肿。如果未经治疗，形成结节性甲状腺肿，进而发生坏死，可形成甲状腺囊肿。当疾病未得到及时有效的控制时，由于坏死组织的分泌物增多，囊肿逐渐增大，此时往往难以自行吸收，因此不会自己好。如果任由其发展，囊肿组织还会逐渐增大，并压迫甲状腺周围组织，严重时还会导致呼吸不畅。