腰椎囊肿可分为椎管内囊肿以及神经根囊肿，病因有所不同。患者需及时到医院就诊，明确诊断后在医生指导下进行对症治疗，包括药物治疗、手术治疗等。
1、椎管内囊肿：可能是因先天性硬膜缺陷导致，也可能是因后天炎症刺激、外伤等原因导致。绝大多数囊肿没有造成神经压迫，也没有明显临床症状，不需要进行治疗，通常患者可每半年进行腰椎核磁共振检查，动态观察囊肿大小和生长变化即可。少数情况下若囊肿较大，可能压迫脊髓或压迫神经并产生明显下肢麻痛和乏力症状，需进行手术治疗；
2、神经根囊肿：可能与神经根远端的蛛网膜异常增生，影响脑脊液正常的流动有关，导致脑脊液堆积形成囊肿，也可能与硬膜的先天性缺陷有关。如果囊肿较小、症状较轻，可暂时定期观察，无需特殊治疗。若症状较重，如疼痛严重，甚至压迫神经导致下肢疼痛、间歇性跛行，则可行CT下穿刺减压，必要时可通过手术将囊肿剥离。
腰椎囊肿手术存在一定风险，因为囊肿多数在椎管内，在剥离囊肿时容易引起椎管内静脉丛损伤出血，形成椎管内血肿。若囊肿与硬脊膜粘连，在分离囊壁时可能造成 神经根或脊髓损伤，所以在手术操作时需小心、仔细、动作轻柔，避免损伤正常组织。通常术后可以给予常规的非甾体类消炎镇痛药对症处理，如布洛芬、阿司匹林等，同时给予甘露醇、地塞米松静滴，可以使神经根消炎、消肿，加快恢复。