通常情况下，耳洞能用生理盐水消毒，可帮助清理耳洞内的污染物，使耳洞部位处于清洁的状态，可在一定程度上预防感染。如果耳洞部位已经出现感染的情况，则不建议用生理盐水消毒。
打完耳洞后耳朵部位会有一定的损伤，所以需要一定的恢复时间，在恢复期间可能会受到外界刺激而引起感染，为避免局部出现感染，建议用生理盐水对耳洞部位进行消毒，如果耳朵里有污染物，用生理盐水消毒能够有效去除污染物，此时耳洞能用生理盐水消毒。如果耳洞部位已经受到感染，出现化脓、疼痛、肿胀等问题，此时用生理盐水并没有较好的消毒、杀菌作用，所以要换用碘伏或双氧水等，能够破坏病毒或细菌的活性，从而达到杀菌和消毒的目的，此时可以用无菌棉球蘸取少量的药液，擦拭耳洞部位。
在耳洞恢复期间要注意耳洞部位不要过早沾水，防止局部出现感染的情况，而且打完耳洞后要佩戴饰品，可有效预防耳洞与局部组织粘连在一起。在对耳洞部位进行消毒时，佩戴的饰品也要同时进行消毒，有利于促进伤口尽快愈合，在恢复期间要以清淡饮食为主，不要吃辛辣刺激性的食物。