酒精擦脸通常会伤害皮肤，损伤程度取决于酒精浓度、皮肤敏感性，以及擦脸次数等因素。偶尔一次使用经过稀释的酒精擦脸，通常对皮肤的伤害较小，若频繁使用酒精擦脸，可能会损伤角质层，伤害皮肤。
临床常用的消毒酒精浓度在65%-80%，酒精属于脂溶剂，并且挥发性较高。使用酒精擦脸可导致皮肤油脂被清除，细胞水分随酒精蒸发，可能会损伤皮肤角质层，伤害皮肤。尤其是眼周皮肤更为脆弱，可能造成的损伤更大，酒精进入眼睛还可能灼伤眼内组织。一般酒精浓度越高，则伤害性越大。此外，若皮肤状态较为敏感，或者存在皮损，使用酒精擦脸还可能会引起疼痛、干痒等不适感，严重时还可诱发过敏性皮炎。
由于酒精对皮肤的刺激性较大，即使使用酒精擦脸后并没有引起不适感，也不建议擅自使用酒精擦脸。临床上脸部皮肤消毒通常用碘伏来替代酒精，几乎不存在手术或针灸治疗使用酒精消毒的情况。若已经使用，没有明显不适，则无需特殊处理，若伴有皮肤刺痛等情况，应及时用清水洗脸，严重或持续不缓解者应及时就医处理。