自闭症的病理原因被证实具有复杂性，轻微自闭症的孩子也需给予全方位干预。目前主要治疗方法包括特殊教育、心理治疗、辅助仪器治疗、药物治疗以及睡眠管理等。
1、特殊教育：轻微自闭症的孩子通常伴有语言能力下降、社交障碍等，需家长和老师共同给予关注，通过一系列特殊教育和训练，如语言训练、智力开发、情感发展、社会交往训练，以提高语言、社交及生活自理能力；
2、心理治疗：轻微自闭症的孩子一般存在心理异常，如认知偏差、封闭、自卑，需给予心理干预，治疗方式包括行为矫正、认知调整、沙盘治疗、音乐治疗等，目的是纠正孩子的刻板行为，恢复其自信，提高心理素质；
3、辅助仪器治疗：如经颅磁刺激，通过产生的感应电流可有效降低前额叶脑区Gamma振荡脑电活动，且可增加抑制性神经递质，从而恢复大脑皮层的兴奋与抑制平衡，对改善轻微自闭症孩子的社交障碍、行为刻板、情绪及理解能力等具有一定作用；
4、药物治疗：轻微自闭症的孩子可能会伴有情绪障碍、行为异常等，可使用精神药物进行干预，临床常用氟哌啶醇、硫利达嗪，以稳定情绪，减轻冲动行为；
5、睡眠管理：轻微自闭症的孩子可能伴有睡眠障碍，需进行睡眠相关管理，如通过睡前听轻音乐的方式，以促进睡眠。