干木耳可能比湿木耳更加健康，但两者在营养方面没有明显区别，适量吃木耳，可以为身体补充所需要的部分营养物质，但是应注意控制摄入量，以免加重机体负担。
干木耳是通过晒干以后所形成，比较容易存放，但是食物安全健康方面，可能干木耳相对来说比较健康，湿木耳的表面含有卟啉，是一种感光成分，在吃了以后经过太阳光照射，容易导致皮肤出现瘙痒、红肿。干木耳经过晾晒后，大部分的卟啉会分解，因此吃干木耳可以降低卟啉的摄入量，减少对身体健康的影响。但是干木耳和湿木耳是同一种食物，干木耳和湿木耳当中的营养成分一样，都可以补充所需要的部分维生素和微量元素。
干木耳一般有利于存放，存放的时候不容易出现变质，存放的时间可能比较长；湿木耳水分含量较多，容易滋生大量细菌，从而导致木耳变质、发霉，在吃木耳的时候需注意观察，也应避免摄入太多，以免增加胃肠道的负担，出现消化不良的情况。