无痛胃镜的麻醉方式主要为全身麻醉，是需要打针的，一般是通过静脉注射，将一定剂量的丙泊酚等麻醉药物注入人体内，使患者的神经、肌肉等活动受到抑制，从而进入短暂睡眠。
无痛胃镜可使患者在操作过程中无意识和无痛苦感，减少了内镜操作带来的痛苦体验，使操作医生能相对不考虑操作时间，从容、仔细、彻底完成相应检查和治疗，可减少遗漏、误诊和因时间仓促，而引起的治疗效果不理想等。同时无痛胃镜还有助于患者减少因紧张、恐惧和不合作等情绪产生的有关并发症，如心血管系统意外、肠痉挛、出血、穿孔等，扩大了内镜检查的适应证，使得一些常规内镜检查的禁忌证，或相对禁忌证，如高血压、精神分裂症以及不合作的老年患者等，均能接受检查。
对于老年人、体弱患者或有心肺疾病的患者，应严格把握麻醉剂量的使用，避免患者在操作过程中，出现血压下降、心率减慢、低氧血症、呼吸抑制等意外。此外，高血压危象、冠心病不稳定型心绞痛、急性心肌梗死等患者禁止使用无痛胃镜，以免发生意外，危及生命。