医院感染是指住院病人在医院内获得的感染，包括在住院期间发生的感染和在医院内获得，出院后发生的感染，但不包括入院前已开始或入院时已处于潜伏期的感染。其感染途径主要是接触传播、空气传播、医源性传播等。
一、接触传播：
1、直接接触传播：是指不经外界任何媒介，直接由医务人员与病人，或病人与病人间互相接触所发生的感染。如金黄色葡萄球菌、巨细胞病毒感染等；
2、间接接触传播：是指接触了带病原体的污染物而发生的感染。如链球菌、金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌、沙眼衣原体、真菌等病原体。在间接接触传播中，医务人员的手在传播病原体上起着重要的作用，因为手经常接触各种感染性物质及其污染物品，很容易再经接触将病原体传播给其他医务人员和病人。
二、空气传播：
是指以空气为媒介而实现的医院感染。该传播方式在结核分枝杆菌感染等呼吸道传播疾病和手术切口部位感染中较常见。在医院内，气管插管及相关操作、心肺复苏、支气管镜检查、吸痰、咽拭子采样以及采用高速设备(如钻、锯、离心等)等操作可产生微生物气溶胶，引起某些呼吸道传染病的医院感染。
三、医源性传播：
1、医疗器械和设备：医院为达到诊断及治疗疾病的目的，常需借助于各种诊疗器械，如各种纤维内镜、呼吸治疗装置、麻醉机、血液透析装置及各种导管、插管等。而这些器械及设备多具有结构复杂、清洁及消毒难度大等特点，加之这些介入性诊疗操作常损伤人体皮肤、黏膜的防御屏障，增加了病人的感染机会；
2、血液及血液制品：可经此途径传播的常见病原体有乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒及艾滋病病毒等。输血(含血液制品)是丙型病毒性肝炎和艾滋病病毒感染的重要途径；
3、药品及药液：各种输液制品在生产或使用过程中受到病原体(尤其是各种条件致病微生物)的污染，多数微生物能在溶液中生长。在口服药物或多种外用药液中，常可检出铜绿假单胞菌、克雷伯菌、肠杆菌、沙雷菌、不动杆菌等条件致病菌。近年来，静脉高能营养液在临床上应用日益广泛，这种液体易受微生物的污染，可引起病人发生菌血症甚至败血症，导致医院感染的发生。
除了上述传播途径，还可以经水传播，医院的水源可因各种原因受到不同程度的污染(如粪便、污水及管道破裂等)或使用了未经严格净化消毒的水，也可导致医院感染的发生，还可以经食物传播，多见于肠道传染病，主要因医院中供应的食物被病原体污染所致。经食物传播的疾病常见的有鼠伤寒沙门菌病、细菌性痢疾、甲型肝炎等。