并非所有的便秘都能够通过做肠镜检查出来原因，一般生理性原因导致的便秘不能被检查出来，病理性原因导致的便秘可以通过肠镜进行诊断，了解肠道内的情况。
1、不能查出：便秘的原因比较多，日常生活中久坐、缺乏运动锻炼、暴饮暴食，以及食入过多油腻、辛辣、高蛋白、不易消化的食物等，都会导致胃肠道动力减慢，使食物无法及时消化和排出，堆积在肠道内引起便秘。此时胃肠道通常没有产生器质性病变，肠镜检查通常正常，不能够被检查出来；
2、能查出：如果肠道内出现了严重的病变，肠道局部有增生状况，如肠道肿瘤、肠道息肉、肠道狭窄等，会导致肠道中的内容物和粪便不能够顺利通过肠道，从而出现便秘，此时可以通过肠镜检查出来。
肠镜属于临床上常见的一种检查方法，在做肠镜前通常需要行肠道准备，将肠道内的粪便以及食物残渣排出体外，避免影响到肠镜的检查结果。肠镜检查后，应该避免吃辛辣刺激性食物，以免刺激肠道。