临床大多认为大脑皮质控制性功能，大脑皮质是覆盖在端脑表面的灰质，大脑皮质中的神经元数量庞大，种类丰富，都是多极神经元。性功能指男女在性活动中，以生理效应为主，并综合心理效应的能力，也就是人类性器官和性行为的功用和能力，包括生殖系统、神经系统、内分泌系统的功能。
阴茎勃起会受到神经系统的支配，而大脑皮质属于调节中枢，也属于性活动的控制中心。一般情况下，在大脑皮质神经中枢与性器官周围神经方面，都会受到大脑皮质的支配，属于性活动的必要条件，因此性功能受到大脑皮质的控制。如果大脑皮质受损，可能会导致相对应的肌群协调功能紊乱，从而出现性功能障碍，以及吞咽障碍、步态异常等情况。
但需要注意的是，性功能还与神经系统、内分泌系统、心理等相关。如果存在性功能障碍方面的问题，建议及时就医进行多学科检查，明确原因后遵医嘱进行针对性处理。