通常情况下，超声胃镜比普通胃镜检查感觉更难受，主要是由于超声胃镜的超声探头比较大，检查时间比较长，在检查过程中带给人的不适感更加难以忍受。
超声胃镜是将内镜和超声相结合的一种检查消化道的技术，将微型高频超声探头安置在内镜顶端，在插入体腔后，可通过内镜直接观察消化道黏膜及其病变，同时也可利用内镜下超声进行扫描，观察胃肠道层次结构、组织学特征及周围邻近脏器的超声图像，还可以了解消化道恶性肿瘤的侵袭范围和程度，诊断胰腺系统疾病等。
胃镜可以发现胃和十二指肠球部、降部的病变，发现胃炎、胃溃疡、十二指肠溃疡、胃癌等，可从胃肠道黏膜上观察到疾病，但是胃镜对于黏膜下的病变无法观察。
因此，具体选择哪种胃镜，主要由医生评估患者病情后进行选择。若患者比较畏惧检查，可与医生沟通选择静脉麻醉实施胃镜操作。