黑眼珠上凹了一个小坑，可能是角膜损伤所致，也可能与角膜溃疡、结膜炎等病变有关，建议出现相关症状后，及时到医院就医明确病因，之后根据情况采取针对性治疗。
1、角膜损伤：如果不慎磕碰或者是眼部遭受外伤，损伤到角膜，可能会使角膜解剖结构出现异常，从而导致黑眼珠上凹了一个小坑，并伴有疼痛、畏光等症状。此时可以遵医嘱使用左氧氟沙星滴眼液，或者是牛碱性成纤维细胞生长因子滴眼液等药物进行治疗；
2、角膜溃疡：如果自身免疫力比较低下，眼睛在遭受外伤后，很容易使眼部受到细菌、病毒等感染，从而引起角膜溃疡，出现黑眼珠上凹了一个小坑的情况，有时还会伴有充血、流泪等症状。此时可以考虑遵医嘱使用更昔洛韦滴眼液，或者是左氧氟沙星滴眼液等药物进行治疗；
3、结膜炎：平时不注重眼部卫生，眼部受到细菌侵袭后，可能会引起结膜炎。若不积极进行治疗，炎症因子持续刺激结膜组织，可能会导致局部缺水，而引起黑眼珠上凹了一个小坑的情况，部分患者还会伴有眼睛刺痛、眼睛发红等症状。此时建议平时保持眼部清洁，并遵医嘱使用红霉素软膏，或者是左氧氟沙星滴眼液等药物进行治 疗。