甲状腺结节5mm×3mm是否严重，需要根据结节病变类型进行判断。通常情况下，如果甲状腺结节属于良性病变，不算严重，只需要定期观察。但如果甲状腺结节为恶性病变，就比较严重，需及时进行治疗。
1、不算严重：随着超声技术不断提高及设备精度不断改进，较小的甲状腺结节都可以在超声下发现。如果甲状腺结节5mm×3mm判断为良性病变，一般不严重，不需要特殊处理，定期观察即可，必要时可遵医嘱服用消肿散结药物控制治疗。小的甲状腺结节即便有恶性倾向，一般也不会特别严重，可通过手术切除，通常预后较好，患者生存期较长；
2、严重：如果5mm×3mm结节出现纵横比>1、肿物内有点状、钙化等超声影像描述，怀疑肿物为恶性病变，此时比较严重，存在癌变可能性。如果放任不管，会影响患者生存期，要积极进行穿刺活检或手术切除，明确肿物性质，必要时可能还需要进行放疗、化疗等辅助治疗。
甲状腺结节患者在日常生活中，要遵医嘱用药，避免摄入含碘量较高、辛辣刺激性食物，如紫菜、海带、扇贝等。此外还要保持良好心态，适当锻炼增强体质，有助于预防甲状腺结节继续发展。