嗜酸乳杆菌与双歧杆菌的区别，主要在于细菌种类、形态特征、分布部位等方面。两者都可用于治疗肠道不适症状，减少肠道疾病的发病概率。
1、细菌种类不同：嗜酸乳杆菌属于乳杆菌属的革兰氏阳性杆菌，而双歧杆菌属于双歧杆菌属的革兰氏阳性杆菌；
2、形态特征不同：由于双歧杆菌种类不同，具有不同形态特征，但多呈直杆状，末端有时呈分叉状，部分可呈勺状形态。而嗜酸乳杆菌一般呈细长杆状；
3、分布部位不同：双歧杆菌可分布在消化道、阴道及口腔。而嗜酸乳杆菌主要分布在胃肠部位。
虽然嗜酸乳杆菌和双歧杆菌有所区别，但两者都是人体主要的益生菌，在临床应用上相辅相成。两者都可用于治疗肠道菌群失衡引起的胃肠道不适，如反胃、恶心、腹泻等症状，可促进胃肠道蠕动，有效防止便秘，以及抑制肠道腐败作用、净化肠道环境。