益生菌多数用于调理肠道菌群平衡和治疗肠道性的疾病，如便秘、慢性肠炎等，益生菌结块有可能是受潮、沾水或过期导致，使益生菌形态发生改变，出现益生菌结块的情况，益生菌出现变质时要禁止使用，防止对肠道健康造成影响。
1、受潮：益生菌中不含有膨松剂，存放环境比较潮湿的情况下，可能会导致益生菌受潮，发生益生菌结块的现象。大多数在保质期之内不会导致益生菌的药性出现失效，通常可以正常使用，但如果出现变质，如发生颜色改变等现象，要禁止使用，防止影响肠道健康影响；
2、沾水：益生菌打开以后如果不小心沾水，会导致出现益生菌结块的现象，此时属于正常反应，不会影响到药物的使用和药性吸收，日后需要注意不要让益生菌沾水；
3、过期：如果益生菌较长时间未使用，导致药物过期，容易使药性失效和形态改变，从而导致益生菌出现颜色改变或出现益生菌结块等现象，还可能会产生微生物或是有害物质，此时应避免使用。
出现益生菌结块现象时最好不要盲目使用，先观察益生菌的颜色及其他是否存在异常，同时要观察益生菌是否在保质期内，确认无误后可以少量使用，若使用后出现 不适症状则应及时停用并就诊。