被水呛嗓子疼可能是咽喉黏膜刺激、感染引起，患者若不适症状长期不缓解，应及时到耳鼻喉科，完善视诊、血常规等检查，遵医嘱治疗。
1、咽喉黏膜刺激：若在喝水时量比较大，并且比较急，可能会使水进入气管，身体为排出异物会引起剧烈咳嗽，持续性呛咳可能会刺激到咽喉部黏膜，引起疼痛。人们在饮水时应避免过急，不要在喝水的时候说话或大笑。
2、感染：若是在游泳时不小心呛了一大口水，游泳池的水含有很多细菌，可能会导致咽喉部位的黏膜发生感染，炎症刺激造成咽喉充血、水肿，引起咽部干燥、灼热感、异物感、咽痛等症状。患者可遵医嘱使用复方硼砂含漱液、复方氯己定含漱液等进行含漱，同时戒烟戒酒，饮食以清淡为主，忌食辛辣刺激性的食物，如辣椒、火锅等，防止咽喉部刺激。
患者还应保持良好的作息习惯，保证充足的睡眠，避免熬夜与过度劳累，可适当地进行体育运动与锻炼，如慢跑、瑜伽等，加强身体抗病能力。