扇贝头部黑色的部分叫砂囊，是扇贝的消化腺，主要包括一些排泄废物、毒素或未消化的食物，一般不可以食用。扇贝含有一些寄生虫、病原菌，建议高温烹饪后食用，避免生食，提高发生寄生虫病的几率。
扇贝的砂囊中包含尚未消化的食物及排泄废物，而扇贝主要以微生物及藻类物质为食物，如果吃扇贝的砂囊，其中含有的毒素，可能会使机体中毒，引发恶心、呕吐、头晕、腹泻等，不利于机体健康，所以扇贝头部黑色的部分不可以食用。另外扇贝中含有丰富的碘元素，碘元素可以促进甲状腺素的合成与分泌，甲状腺功能亢进症、甲状腺炎、甲状腺结节人群应少吃扇贝，以免加重病情。
建议吃扇贝的时候，选择大小适中、无异味、无缺损的扇贝，通常口感较好。另外扇贝属于凉性物质，如果过多食用可能会刺激胃肠道，加重胃肠道负担，建议适量吃扇贝，婴幼儿或脾胃功能较差的人群应慎用扇贝。