新生儿眼底筛查的主要目的，就是早期发现视网膜病变的情况。除了发现早产儿、低出生体重儿以及患有肺炎的新生儿的视网膜病变以外，眼底筛查也可以筛查其他新生儿视网膜病变，如先天性视网膜发育不全，尽早发现治疗可降低失明率。
建议所有的新生儿都应该做眼底筛查，能够及时发现视网膜病变。对于早产儿、难产、剖宫产或出生后有吸氧史的新生儿应重点筛查，筛查时间是从出生后第4周或矫正胎龄32周开始，用间接眼底镜或眼底数码相机检查眼底，并定期随访。如果发现病变要尽早进行治疗，以免影响以后的视力。
除眼底筛查外，对所有产科出生及儿科住院的新生儿，还要应用耳声发射进行听力筛查，在出生后3天、30天各查1次，如筛查未通过需做脑干诱发电位检查，并于产后42天随诊时进行复筛。早产儿易发生低碳酸血症、感染等，应重点检查。