首先需要明确，益生菌主要是通过调节肠道菌群，从而缓解肠道功能紊乱，并不具有抗过敏的作用。其次，如果出现过敏的症状，应及时就医，在医生帮助下使用药物进行治疗。
过敏在医学上也被称为变态反应，是指人体与抗原物质接触后发生的异常免疫反应，常导致生理功能紊乱或组织损伤，而益生菌并不能通过任何机制进行抗变态反应的治疗。临床上常用药物进行治疗，主要分为抗组胺药(如盐酸苯海拉明片)、抗白三烯及其他介质药(如扎鲁司特片)，肥大细胞膜稳定剂(如色甘酸钠气雾剂)及其他抗过敏药如免疫抑制剂糖皮质激素(如泼尼松片)、钙剂(如葡萄糖酸钙口服溶液)等四类。
但是通过服用益生菌对于胃肠型变态反应能起到一定的辅助作用，可以促进胃肠道功能的恢复。除此之外，防止变态反应的最佳方法是避免接触抗原物质，也就是俗称的过敏原，可以到正规医院进行过敏原检测。