月经干净两天同房出血，可能是正常情况，包括子宫内膜修复不全、残留月经血，也可能是月经不调、阴道损伤、宫颈炎、宫颈息肉、黏膜下子宫肌瘤等异常情况，需要根据情况进行分析。
一、正常情况：
1、子宫内膜修复不全：月经刚刚结束两天，子宫内膜可能未修复完全，同房后重新刺激子宫内膜，进而引起出血，一般出血量不大，通常不用过度担心；
2、残留月经血：月经干净后两天，可能子宫腔内残留的褐色积血未完全排出，同房后可能会使少量积血排出体外，一般属于正常情况。
二、异常情况：
1、月经不调：出现内分泌紊乱时，可能会引发月经不调，导致月经干净后同房时再次来月经；
2、阴道损伤：如果同房时行为粗暴，可能会导致阴道裂伤，导致同房后出血，此时出血量相对多，且出血时间较长，可能伴有腹痛；
3、宫颈炎：如果存在宫颈炎，同房后可能会刺激局部黏膜，导致局部黏膜破损、出血，但通常出血量较少，一般为鲜红色血液；
4、宫颈息肉：息肉为突出样组织物，是宫颈上皮细胞增生形成的突起，表面发红、质地较脆，同房后受到一定的刺激容易出血；
5、黏膜下子宫肌瘤：黏膜下子宫肌瘤压迫子宫，可能会使宫腔变形而影响子宫收缩，同房后就可能导致阴道出现不规则出血。
另外，宫颈癌也可能导致症状出现。宫颈癌病灶处细小血管较多，组织较脆弱，所以在月经干净后同房毛细血管易发生破裂，从而发生出血的症状。同房本身对人体没有太大伤害，但有时也会导致子宫内膜出血，如果同房时偶然出血，可以暂时观察，不用进行特殊处理。但如果每次同房后子宫内膜都会出血，这时需要去医院进行检查，除普通妇科检查外，还应该进行宫颈防癌筛查。