甲状腺球蛋白抗体和过氧化物酶抗体均属于自身抗体，升高是甲状腺自身免疫疾病的表现。引起甲状腺球蛋白抗体和过氧化物酶抗体偏高的主要原因，包括桥本甲状腺炎、Graves病、产后甲状腺炎。
1、桥本甲状腺炎：又称慢性淋巴性甲状腺炎，主要由于甲状腺腺体破坏导致自身免疫反应，产生自身抗体，使甲状腺球蛋白抗体和过氧化物酶抗体偏高，主要表现为甲状腺肿大，部分患者可无甲状腺肿大。对于症状较轻的患者，通常不予以特殊治疗，主要通过饮食控制，注意少食海带、紫菜等含碘高的食物。对于症状较重的患者，控制饮食外，可在医生的指导下，使用甲状腺激素替代疗法治疗，如左甲状腺素钠；
2、Graves病：又称弥漫性毒性甲状腺肿，是伴甲状腺激素分泌过多引起的自身免疫疾病，部分患者会出现甲状腺球蛋白抗体和过氧化物酶抗体升高，主要表现为易激动、精神紧张、怕热、多汗、甲状腺呈弥漫性对称性肿大、突眼、食欲亢进、体重下降等，可在医生指导下，使用抗甲状腺药物治疗，如甲巯咪唑、丙硫氧嘧啶等，也可进行放射性碘-131治疗。对于甲状腺肿大较严重、抗甲状腺药物治疗后复发、甲状腺肿大且压迫邻近器官等病情较重患者，可进行手术治疗；
3、产后甲状腺炎：发病机制尚不完全清楚，目前认为在妊娠期间，为了使与母体免疫原不同的胎儿能在母体内存活，母体处于免疫抑制状态。产后由于雌孕激素水平下降，母体的免疫抑制状态解除，使甲状腺出现自身抗体，导致甲状腺球蛋白抗体和过氧化物酶抗体偏高。患者可在产后3-12个月出现甲状腺功能异常，患者需定期复查，部分人会发展为永久性甲减，此类患者可在医生指导下，使用甲状腺激素替代疗法治疗，如左甲状腺素钠。